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云河藥業先后與中國中醫科學院、中國中醫科學院中藥研究所、中國科學院武漢病毒研究所、中國醫學科學院藥用植物研究所云南分所、昆明醫學院天然藥物藥理重點實驗室、北京廣安門醫院、浙江大學、北京中醫藥大學、云南省中醫學院等科研單位及院校建立了良好的戰略合作關系，技術研發與技術應用的系統結合，可有效推進技術轉化并提升現實的生產力。